1. Posebna izrada, teška proizvodnja i visoka cijena. Zbog posebnih svojstava kvarcnog stakla, proizvodnja germicidnog svjetiljka se ne može skalirati, što rezultira visokim troškovima kvarcne germicidne svjetiljke i otegava njegovu daljnju popularizaciju i primjenu.
2. Svjetlosno propadanje je veliko i životni vijek nije dug. Nakon što se ultraljubičasta germicidna lampa zapali stotinama sati, njen intenzitet ultraljubičaste svjetlosti brzo propada, dostižući maksimalno 30%, a efekt sterilizacije je uveliko smanjen. Osim toga, oštećenje katoda uzrokovano tokom obrade utječe i na život UV germicidne svjetiljke. Budući da osvjetljenje ultraljubičastih germicidnih svjetiljki i fluorescentno osvjetljenje nisu baš isti u mehanizmu, ovaj problem tek treba riješiti sve strane.
3. Zbog različitih filamentnih i katodnih materijala, UV lampe iste snage kao T8 i T5 fluorescentne lampe ne mogu se voziti istim balastom.
